該計劃要求,實施分區控制,優化生态文明建設空間格局。西江、北江和韓江等供水通道岸線1公裡敏感區範圍内禁止新建印染、鞣革等重污染項目,幹流沿岸嚴格控制化學纖維制造、印染等項目環境風險。北江流域嚴格實行重金屬污染物減量置換。推進鞣革、印染等重污染行業的統一規劃、統一定點管理,于2018年底前依法關停污染嚴重、難以治理又拒不進入定點園區的重污染企業。并提出,在重點行業、重點領域實行更嚴格的水污染物排放限值。2017年底前,基于水質目标制訂茅洲河、小東江、練江等流域水污染物排放地方标準。對珠三角區域的紡織染整、合成革和人造革等行業逐步收嚴水污染物排放标準。
此外,還要加大工業集聚區水污染治理力度。針對茅洲河、練江等重污染河流,該計劃要求加強跨界河流水環境綜合整治,其中,練江流域要加快污水、垃圾等環境基礎設施以及紡織印染環保綜合處理中心建設,2018年底前完成印染企業搬遷入園。小東江流域2017年底前完成全部皮革和石化園區建設。該計劃提出實施跨界水環境補償,在淡水河、石馬河流域開展排污權有償使用和交易試點研究。